У вас замысловатая схема питания. Если не открывается с брелка, но открывается при запитывании бортовой цепи, то, конечно, какой-то из аккумуляторов. Выяснить это проще простого обычным тестером!
Как выяснилось позднее :происходит самопроизвольная разрядка акб в состоянии покоя. При повороте ключа зажигания до пуска двигателя выдает ошибку (battery protection :convenience functions temporarily unavailable) какой именно блок не "засыпает " предстоит выяснить. При езде через некоторое время ошибка исчезает. При стоянке от 10 и более часов акб разряжается и машина не заводится.