Добрый день, уважаемый автовладелец!
При исправно рабочей системе, никакого тепла в салон поступать с радиатора отопителя не должно. 
Глушите смело, перегрева не будет, так как радиатор не отдает тепло в салон при выключенной печке. 
Но особого результата(холоднее в салоне) не станет.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia