Добрый день, уважаемый автовладелец! 
При замене ШРУСа таких последствия быть не должно.
Как вариант что-то задели, или данная неисправность была и просто не так ярко проявлялось, и сейчас это банальное совпадение.
Возвращайтесь на станцию с претензией, пусть проверяют всё что трогали, привод управления коробкой, кулисы и тяги, их втулки, механизм рычага переключения.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia