Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Естественно, если замкнуть реле бензонасоса, тогда он будет работать, так как по цепи может быть только предохранитель, который обрывает цепь при замыкании, больше ничего в цепи нет. Предохранитель тоже не помешает проверить, так как он может быть и до реле.
Проверяйте всю проводку, которую затронули во время ремонта, предугадать откуда начинать сложно. 
Предварительно посмотрите контактную группу замка зажигания.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia