Добрый вечер!
Подвеска Вашего авто довольно проста, стучать там могут или амортизаторы, или пружины, в крайнем случае разорванные сайлентблоки балки. 
Загоняйте авто на подъемник, смотрите состояние подвески. 
Если это не она - тогда подшипник, арки, выхлопная система - все что может шуметь при езде.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia