Добрый день.
Вряд ли из за генератора будет троить двигатель. Однако натяжку ремня лучше проверить, т.к. при плохой натяжке быстро сядет АКБ. Если двигатель троит надо проверять свечи, провода, катушку(можно поменять местами с работающими цилиндрами, чтобы убедится в исправности заменяемой запчасти, а можно поставить новую). Так же проверьте исправность форсунок, замерьте давление топлива.
Москва, Subaru Impreza