Добрый день. Все-же болезнью "RX-ов" является течь через крышку багажника, поэтому начать осмотр рекомендовал бы именно с него. Поднимите пол, осмотрите нишу с запаской, и боковые стойки под обивкой, нет ли там следов воды. И подскажите, какие-либо кузовные ремонты были у автомобиля? ДТП в заднюю часть случались?
Ну и самый действенный способ, это снимать обивки, сажать человека в салон и на мойку высокого давления. Так поиск будет намного продуктивней.
Mazda 3