Добрый день уважаемый автовладелец!
Если возникает шум при нейтральной передаче, который пропадает когда выжато сцепление - это говорит о выработке в подшипниках первичного вала коробки передач.
Это не критично, но готовиться к ремонту нужно.
Херсон, Skoda Octavia