Здравствуйте!
Вполне возможно что вышел из строя силовой ключ контроллера - сопротивление транзистора в открытом состоянии больше чем положено - отсюда нагрев и некорректная работа. Контроллер можно починить при должной квалификации.
Так же проверьте сопротивление катушек зажигания и форсунок. Если их сопротивление различается, замените те, у которых сопротивление ниже.
Мытищи, LADA (ВАЗ) 2120