Добрый день!
Вибрировать может как и сам редуктор, так и подвесное оборудование трансмиссии: опоры, подушки, двигателя и коробки, карданный вал, задняя балка на сайлентблоках и т.д.
Проверйте в первую очередь ходовку, подушки трансмиссии, кардан.
После уже займитесь коробкой и мостом, но если он не воет или не вибрирует в ходу, то его еще рано списывать в ремонт.
Херсон, Skoda Octavia