Добрый день! Попробуйте проверить также и на холостом ходу, если шум пропадает, то это очень похоже на выжимной подшипник и вам быстрей всего придется снимать КПП и его менять. Также возможно, что это подшипник первичного вала КПП.
Ростов-на-Дону, Kia Ceed