Почему на прогретом двигателе на холостом ходу машина троит?

Если машина троит, то в первую очередь проверяются катушки и свечи с помощью специальных приборов и диагностического оборудования.
Если дергается стрелка тахометра, то стоит проверить показания датчика положения коленчатого вала как через сканер, так и напрямую с помощью осциллографа. Возможно проблема в нем или в зубчатом колесе этого датчика на коленвалу.
Также стоит проверить компрессию во всех цилиндрах.

Так же причиной дергания стрелки и троения может быть электромагнитная помеха(наводка) на сигнальный провод датчика положения коленвала. Такое может произойти если массовый провод этого датчика где-то на двигателе замкнут на массу. Оба провода от датчика подсоединяются НЕПОСРЕДСТВЕННО к контактам ЭБУ, т.е. если есть сомнения, нужно провода прозванивать от разъема датчика до разъема ЭБУ.

Пробитая катушка тоже работает, но переодически может делать пропуски. Пробитую можно вычислить только по осциллограмме высокого напряжения. Учтите, что пробитая катушка может вывести из строя ЭБУ, а вернее силовой транзистор, который такой катушкой управляет.
Неравномерность холостого хода может быть из-за загрязнения дроссельного узла, т.е нужно провести чистку дроссельной заслонки и клапана холостого хода. Так же рекомендую проверить дымогенератором впускной коллектор на наличие нештатного подсоса воздуха в задроссельное пространство.
Комплексная диагностика ДО и ПОСЛЕ таких процедур обязательна.
Что касается клапанов, на Вашем авто , если судить по модельному году, регулировка должна осуществляться подбором толкателей. Но если хотите на 100% знать, то мне нужен VIN авто, чтобы конкретно ответить.

Схема из каталога приложена, как я и писал выше на двигателе клапана регулируются подбором толкателей.
Их размер предусмотрен производителем от 3мм до 3,6мм.