Ждите, пока адаптируется. В смысле, ездейте как обычно, но с выводами не торопитесь. Если нет неисправностей, всё само заработает как раньше.
Неисправность АКПП проявляется обычно во время переключений. Дергаться может и по причине неисправной системы зажигания мотора. Нужно провести диагностику.