Здравствуйте.
Давление топлива влияет на общий запуск двигателя, от ключа или сигнализации, не важно. Если с ключа все время запускается при тех же условиях (пробуйте сразу заводить, не выжидая время после включения зажигания), то ищите проблему в сигнализации. Сигнализация не видит давление топлива.
Если и с ключа не запускается, то проверьте давление топлива, может оно низкое, из за клапана давления. При включении зажигания включается топливный насос и подкачивает топливо, при автозапуске может не быть времени для подкачки топлива, смотря как реализован автозапуск.
Балаково, Kia Ceed