Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Если все вышеуказанные детали трансмиссии в норме, а именно ШРУСы, крестовины, коробка и мосты обслужены, то пересмотрите еще раз ходовку авто, и смените сайлентблоки подрамника, проверьте подушки мотора и трансмиссии.
На подрамнике "висят" элементы трансмиссии, вот скорее всего из-за износа сайлентблоков наблюдается такая картина.
Херсон, Skoda Octavia