Добрый день, уважаемый автовладелец!
В таком случае, проверьте подушки АКПП, мотора, чтоб исключить передачу вибрации, или всевозможных толчков на кузов через изношенные подушки.
Если дело в коробке, тогда еще раз сливать масло, смотреть его состояние, считывать ошибки, и далее уже принимать решение о ремонте, или продолжение эксплуатации.
Херсон, Skoda Octavia