Вы устанавливали сами или в салоне?
Найдите блок сигнализации и проверьте - перерезана-ли перемычка под крышкой. Для АКПП она должна быть перерезана.
Установщик сигнализации мог поставить так как на МКПП.
P.S. все работы вы выполняете на свой страх и риск.
Россия, Mercedes-Benz M-Class