Выдает код ошибки 45-01 Honda Stepwgn, что делать?

Здравствуйте, код ошибки 45-01 в Honda с АКПП не связан.
45 - Это неисправность системы подачи топлива, неисправность разъема датчика кислорода или давления, или не отрегулированные клапана.
1- Отсоединение или неисправность датчика кислорода или пропуски зажигания.
Этот код неисправности говорит о невозможности системы управления создать такую топливоподачу, чтобы сигнал датчика определял бедную смесь. Если регулятор топлива неисправен или обратный трубопровод пережат, то повышение давления в топливной рампе может привести к этому коду неисправности. Грязные форсунки могут резко увеличить свои расходные характеристики и заливать двигатель независимо от расчетной топливоподачи.
Из этого следует, что скорей всего при проведение работ по коробке Вы повредили или не подсоединили датчики. Возможно пережали топливопровод обратку или не подсоединили клапан обкатки (хотя вряд ли). Или неправильно установили ремень ГРМ или зажали клапана.
Вам желательно сделать диагностику профессиональным сканером, лучше дилерским и считать еще раз ошибку.

Хотя, возможно Вы правы, в данном случае 45-01 может означать по шифровке OBD-2 ошибку Р0780 - ошибка переключения, механическая неисправность в гидравлической системе управления. Диагноз не очень хороший, зачастую причина в том, что забились продуктами износа один или несколько каналов для рабочей жидкости АКПП. Как правило это ведет к замена коробки. А то, что горит D - это сообщение о неисправности в АКПП.