Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
По какой причине меняли клапан? 
По вышеописанному сложно судить, по какой причине авто глохнет, но если такая работа мотора наблюдается после ремонта, то в первую очередь нежно осматривать все системы и электрооборудивание авто, которые затрагивались при ремонте. 
Саму ГБЦ собрали скорее всего верно, так как ошибки при таких работах допустить сложно, и наблюдался бы посторонний звук при работе мотора. 
Проверяйте все навесное оборудование которое участвовало при ремонте.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia