Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Проверяйте опоры двигателя, коробки, которые могут быть изношены и при нагрузке элементы силового агрегата будут соприкасаться с кузовом вызывая стук.
Может есть нюансы и по выхлопной системе, самому мотору, трансмиссии авто. загоните авто на подъемник, и проверьте с днища, погазуйте, может будет слышен этот звук и при таких проверках.
Херсон, Skoda Octavia