Здравствуйте!
Конструкция 406 мотора не предусматривает регулировку зажигания в рамках ТО. Но если у вас карбюраторный мотор, то проблема может быть в его "переливе" (в инжекторе тоже, но из-за датчиков)
Возможно из-за разницы в толщине прокладок "ушли" фазы ГРМ или изменилась степень сжатия.
Вообще же плохое поведение прогретого мотора может быть связано с "зажатыми" клапанами из-за отказа гидрокомпенсаторов или чрезмрного давления масла в ГБЦ, по этой же причине масло может попадать в камеры сгорания, отсюда сизый дым.
Мытищи, LADA (ВАЗ) 2120