Доброе время суток, по всей вероятности у вас пропуски воспламенения, блок управления двигателем отключает не рабочий цилиндр, а после перезапуска ЭБУ все опять приходит в норму. Проверьте в первую очередь состояние свечей, катушек зажигания, разъемов на них ,а так же разъем топливных форсунок. Как правило всему виной Катушка зажигания. Удачи
Москва, Skoda Superb