Возможные причины в неисправности датчика колен.вала или распредвала. Скорее всего,когда у вас мигает,или загорается "чек" ошибка остается в памяти, но на вашем автомобиле, если какое-то время ошибка не проявляется,контроллер обнуляет память. Обязательно нужно проверить что за ошибка.
Указанные датчики,при нагреве могут давать искаженный сигнал, тем самым внося коррективы в работу ГРМ. Общее описание проблемы похоже еще на смещение меток в ГРМ, но так как неисправность проявляется при нагретом двигателе, то скорее датчики.
Нижний Новгород