Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Скорее всего, проблема в кулисе, которая разболталась, или открутилось крепление к ручке переключения передач.
Разберите этот узел, сделайте ему ревизию. 
Судя по частоте повторения неисправности, скоро можно добиться полного отсоединения кулисы и "зависании" коробки на пятой передаче.
                                    
                                                    Херсон,                                                                            Skoda                            Octavia