Здравствуйте.
Если до замены главного тормозного цилиндра, все работало исправно, то вероятно проблема как раз в нем, возможно брак. Попробуйте еще максимально развести задние колодки и прокачайте систему. Так же стоит проверить тормозные шланги (внутреннее расслоение).
Балаково, Kia Ceed