Добрый вечер, уважаемый автовладелец!
Проблемы могут быть как и по электронной части систем управления коробкой, так и механическим элементам, рычагу переключения, датчиков его положения.
На такого рода автомобилях, без предварительной диагностики ничего сказать не получится, придется отгонять авто на станцию для подключения сканера, и считывания кодов неисправности.
Херсон, Skoda Octavia