Добрый день.
Видимо при замене цепи ошиблись с выставлением меток или промахнулись. В результате рассинхронизация фаз газораспределения. Надо проверять метки. Так же советую в не рабочие цилиндры поставить новые свечи, катушку и ВВ провод. Как вариант: взять свечу и катушку с рабочего цилиндра и поставить на не рабочий. Если цилиндр с которого переставили свечу и катушку откажет - причина в системе зажигания.
Москва, Subaru Impreza